ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอท่าเรือ  จัดสร้างขึ้นตามประกาศของกระทรวงศึกษาธิการ   “  เรื่องการจัดสร้างศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียน / กิ่งอำเภอ   ลงวันที่  27   สิงหาคม   2536  ”  โดยได้ใช้ชื่อสถานศึกษาว่า  “ ศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอท่าเรือ ”  ซึ่งมี   นางพรทิพย์   จันทรวิเชียร   ตำแหน่งอาจารย์  2   ศูนย์การศึกษานอกโรงเรียนจังหวัดพระนครศรีอยุธยา        มาปฏิบัติราชการในหน้าที่หัวหน้าศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอท่าเรือ  ตั้งแต่วันที่ 2  กุมภาพันธ์  2537 โดยใช้อาคารห้องสมุดประชาชน “เฉลิมราชกุมารี”  อำเภอท่าเรือ   เป็นที่ปฏิบัติงานซึ่งค่อนข้างคับแคบไม่พอเพียงต่อการปฏิบัติงานของบุคลากร และผู้มาติดต่อประสานงาน ต่อมาในปีงบประมาณ  2543 ได้รับความอนุเคราะห์ให้ใช้ด้านหลังหอประชุมอำเภอท่าเรือกั้นเป็นสำนักงานศูนย์บริการการศึกษานอกโรงเรียนอำเภอท่าเรือ เมื่อการปฏิรูปโครงสร้างกระทรวงศึกษาธิการ เมื่อวันที่ 7 กรกฎาคม  พ.ศ. 2546  จึงได้เปลี่ยนเป็น สังกัดสำนักบริหารงานการศึกษานอกโรงเรียน  สำนักงานปลัดกระทรวง  กระทรวงศึกษาธิการและเมื่อพระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย 2551     มีผลบังคับใช้กระทรวงศึกษาธิการจึงได้ประกาศรายชื่อสถานศึกษา  ที่มีความพร้อมในการปฏิบัติภารกิจของสถานศึกษาตามพระราชบัญญัติส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย 2551  เมื่อวันที่  10  มีนาคม  พ.ศ. 2551  โดยเปลี่ยนชื่อสถานศึกษาเป็นศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอท่าเรือ  สังกัดสำนักส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยจังหวัดพระนครศรีอยุธยา  สำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย  สำนักงาน ปลัดกระทรวง  กระทรวงศึกษาธิการ
             ศูนย์การศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยอำเภอท่าเรือ   สังกัดสำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัยจังหวัดพระนครศรีอยุธยา สำนักงานส่งเสริมการศึกษานอกระบบและการศึกษาตามอัธยาศัย  สำนักงานปลัดกระทรวงศึกษาธิการ  โดยมีบทบาทหน้าที่และความรับผิดชอบดังนี้

                 จัดและให้บริการการศึกษานอกระบบ  และการศึกษาตามอัธยาศัยตามความต้องการและสภาพปัญหาของท้องถิ่น 
                 จัดและประสานงานให้มี กศน.ตำบล  หน่วยจัดการศึกษานอกโรงเรียนเพื่อเป็นเครือข่ายการบริหารการศึกษานอกโรงเรียน ได้อย่างกว้างขวางและทั่วถึงและส่งเสริมให้ชุมชนจัดการศึกษาของตนเองในลักษณะ กศน.ตำบล เพื่อเป็นศูนย์กลางในการจัดการศึกษาวางแผนและบริการการศึกษา  ต่อสมาชิกในชุมชนและระหว่างชุมชน

                 สนับสนุนสิ่งจำเป็นและสื่อต่างๆ  ที่ใช้ในการดำเนินงานการศึกษานอกโรงเรียนของเครือข่ายทั้งภาครัฐและเอกชน  เพื่อให้เกิดกระบวนการเรียนการสอนและบริการแก่กลุ่มเป้าหมายกำกับดูแล  ติดตามและรายงานผลการดำเนินงานการศึกษานอกโรงเรียน